
简单易用
简单易用
您从Choppy Store中找到自己需要的Choppy App安装到本地环境,用Excel表准备一个Samples文件即可开始生信Pipeline分析之旅。

跨平台
跨平台
任何支持 Python2 和 Python3 语言的平台都可以运行 Choppy,包括 Windows、Mac、Linux。挑一个您喜欢的就行!但我们更推荐使用云环境,比如我们当前所支持的阿里云平台。

可重复性
可重复性
Choppy 通过多种技术来保障用户生信 Pipeline 分析的可靠性与可重复性。比如:Docker、Git、对象存储、WDL 等。

开源化与标准化
开源化与标准化
所有的代码都开源在 GitHub 和 Choppy 上,赶快加入我们来共同发展这个项目!还等什么?成为贡献者吧!
Choppy快速指南
Choppy 功能特性
- Workflow提交: 指定的cromwell server上运行workflow
- Workflow重启: 重启之前提交过的workflow
- Workflow查询: 获取指定workflow运行状态、metadata以及日志
- Workflow解释: 获取失败workflow详细信息
- Workflow监控: 监控指定workflow
- Workflow终止: 停止指定workflow
- JSON校验: 校验JSON输入文件
- App安装与卸载: 支持多种方式安装App
- App运行: 提交Samples文件运行指定App
- OSS管理: 上传、下载、查看与复制OSS上文件
- Docker镜像: 支持用户指定软件名-版本号自动生成Docker镜像
- 项目文件版本控制: 支持用户对运算相关项目文件进行版本控制,并同步到choppy仓库中
Who is Using This?
This project is used by all these people